安徽某貿易公司從日本采購日用品，因為與境外發貨人有特殊關系，所以進口價格以國外市場商品采購價格來定價。（不含境外發貨人的采購成本，利潤，運費成本等）因為特殊關系取得優惠價格，而且買賣價格是雙方自由協定達成的，按進口價格向海關申報是沒有問題的。但是該公司在進口申報時，特殊關系欄目申報為【無】。由于進口價格比其他公司同類商品進口價格低很多，海關在質疑該公司申報價格時就發現了與境外發貨人的特殊關系。該公司因為申報不實被海關處罰。本來挺好的一樁生意，就蒙受了不必要的損失。
假設該公司在進口申報時，還是以同樣的價格申報，但特殊關系申報為【有】，對價格的影響也申報為【有】。那會出現什么樣的情況呢？海關當然不以該公司申報的進口價格作為進口完稅價格，也不會因為有特殊關系就構成違規行為，而是進行價格磋商，一般以相同或類似貨物成交價格估價方法，確定進口完稅價格。
海關完成估價后，企業按進口完稅價格繳納關稅及增值稅，并不影響進口發票和合同上的成交價格，進口報關單的申報價格仍然是企業原來的進口價格，并按此價格對外付匯。也就是說對企業達成的優惠采購協議是沒有影響的，只不過繳納了本來就應該正確繳納的稅金。
大數據時代，特殊關系是無法隱瞞的，而且進出口業務中如實申報是最重要的原則，堅持這個原則辦事，業務就會簡單順利，反之則艱難曲折。
當然還有相當一部分特殊關系是不影響進口價格的，只要企業認為該價格和相同與類似商品進口價格相近，又或者進口價格已經包含了所有應該包含的費用和成本，即體現了發貨人的成本，利潤，又包含了買方應支付的費用，就可以申報特殊關系【有】，對價格的影響【無】。
參考：特殊關系有哪些
（一）買賣雙方為同一家族成員的；
（二）買賣雙方互為商業上的高級職員或者董事的；
（三）一方直接或者間接地受另一方控制的；
（四）買賣雙方都直接或者間接地受第三方控制的；
（五）買賣雙方共同直接或者間接地控制第三方的；
（六）一方直接或者間接地擁有、控制或者持有對方5%以上（含5%）公開發行的有表決權的股票或者股份的；
（七）一方是另一方的雇員、高級職員或者董事的；
（八）買賣雙方是同一合伙的成員的。
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